MRI tutkii aivojen rakenteiden tilaa muodon, koon ja kudostiheyden mukaan. Huomaa, että MRI heijastaa kudoksen tiheys funktiona vesipitoisuus, ja näin ollen ensimmäinen leesioiden, kuten aivojen turvotus-turvotusta (ONGM), demyelinoivat sairaudet, tuumorit.