P. Jiroveci on mikro-organismi, jonka taksonomista asemaa ei ole määritelty. Useimmat tutkijat pitävät sitä yksinkertaisimpana (alatyypin Sporozoa, luokan Haplospora). Viime vuosina on kuitenkin kertynyt tietoa, että ribosomaalisen RNA: n nukleotidisekvenssin mukaan pneumokokit ovat lähempänä sieniä. Se on ekstrasellulaarinen loinen, jolla on pääasiallinen tropismi keuhkokudokseen, joka vaikuttaa ensimmäisen ja toisen asteen pneumokyyttiin.