Pohjukaissuolen kehittymisen poikkeavuudet ovat harvinaisia. Atresia, synnynnäinen ahtauma ja rainoitetun kalvofuusion pohjukaissuolessa havaitaan muutaman ensimmäisen päivän kuluessa syntymästä: tunnettu siitä, että runsas oksentelua, usein oksentelua ja muut oireet, korkea suolitukos.