EEG-analyysi suoritetaan tallennuksen aikana ja lopulta sen päätyttyä. Tallennuksen aikana arvioidaan esineiden esiintymistä (verkon kentän tarkennus, elektrodien liikkeiden mekaaniset esineet, elektromyogrammi, EKG) ja ryhdy toimenpiteisiin niiden poistamiseksi. EEG: n taajuus ja amplitudi arvioidaan, tunnusomaiset kaavioelementit tunnistetaan, niiden spatiaalinen ja ajallinen jakauma määritetään.