Kaikki probiootit jaetaan useisiin ryhmiin riippuen siitä, mikä on luokittelun perusta. Probioottinen koostumus voi sisältää useita komponentteja, tässä yhteydessä monokomponentti-valmisteet eristetään, joilla on vain yksi erityinen bakteerityyppi. Nämä mikro-organismit ovat epäilemättä hyödyllisiä suolistossa, erityisesti mikroflooraa varten.