Kliininen diagnoosi on luotettava vain kroupus keuhkokuumeeseen, mutta pneumokokki-etiologian todennäköisyys yhteisössä hankitun keuhkokuumeen, otitis, sinuiitti on 60-80 °. Tarkistaa diagnoosi voidaan tulosten perusteella mikrobiologisten tutkimusten vastaavan biosubstrate: nuha - nenän vuotamista (aivohalvaus), jossa korvatulehdus, poskiontelotulehdus - märkivä eritettä, keuhkokuume - yskös, aivokalvontulehdus - aivo-selkäydinnesteestä.