Akuutti pyelonefriitti on hyvin selkeä kliininen oireyhtymä. Jonka muodostavat akuutti puhkeaminen ja kuume, kylki kipua ja lihasjännitystä rivan nikaman kulma liittyy leukosytoosi ja leukocyturia bakteerivirtsaisuuden. Näihin oireisiin voi liittyä kystiitti, johon liittyy usein, kivulias virtsaaminen.