Akuutti pyelonefriitti on kliinisesti tarkkaan määritelty oireyhtymä, johon kuuluu äkillinen alkaminen, kuume, kylkikipu ja nikamanselkäkulman lihasjännitys, johon liittyy leukosytoosia, leukosyturiaa ja bakteriuriaa. Näihin oireisiin voi liittyä virtsarakontulehdus, johon liittyy tiheää ja kivuliasta virtsaamistarvetta.