HCV-genomi sisältää positiivisesti varautuneen yksijuosteista RNA: ta, joka koodaa 3 rakenteellisia (nukleokapsidiytimen proteiini ja nukleoproteiiniantigeenit E1-E2 kirjekuoressa) ja 5 rakenteelliset (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteiineja. Kukin näistä proteiineista syntetisoidaan vasta löydetty potilaiden verestä, joilla on hepatiitti C