Naapurigeenien mikrodeleiot kromosomissa aiheuttavat hyvin harvinaisia oireyhtymiä (Prader-Willi, Miller-Dicker, Di-Georgie jne.). Näiden oireyhtymien diagnoosi oli mahdollinen kromosomivalmisteiden valmistusmenetelmän parantamisen vuoksi. Siinä tapauksessa, että mikroruudutusta ei voida havaita karyotyypillä, käytetään DNA-koettimia, jotka ovat ominaisia deleetion alaiselle alueelle.